Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Fam35aQ3UEN2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Fam35aQ3UEN2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Fam35aQ3UEN2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Fam35aQ3UEN2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam35aQ3UEN2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam35aQ3UEN2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam35aQ3UEN2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam35aQ3UEN2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam35aQ3UEN2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam35aQ3UEN2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam35aQ3UEN2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms