Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf166Q3U9F6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf166Q3U9F6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf166Q3U9F6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf166Q3U9F6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf166Q3U9F6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf166Q3U9F6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf166Q3U9F6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf166Q3U9F6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf166Q3U9F6 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf166Q3U9F6 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf166Q3U9F6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Zfp978-202ENSMUST00000154154 1250 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 1700063D05Rik-204ENSMUST00000213914 1007 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r37-206ENSMUST00000228791 1617 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 AC160991.2-201ENSMUST00000223784 1135 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms