Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U595 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U595 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms