Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Kdm4dQ3U2K5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Kdm4dQ3U2K5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Kdm4dQ3U2K5 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Kdm4dQ3U2K5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Kdm4dQ3U2K5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Kdm4dQ3U2K5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Kdm4dQ3U2K5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Kdm4dQ3U2K5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Kdm4dQ3U2K5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Kdm4dQ3U2K5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Kdm4dQ3U2K5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Kdm4dQ3U2K5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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