Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf149Q3U2C5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rnf149Q3U2C5 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rnf149Q3U2C5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rnf149Q3U2C5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rnf149Q3U2C5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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