Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccndbp1Q3TVC7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccndbp1Q3TVC7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccndbp1Q3TVC7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccndbp1Q3TVC7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccndbp1Q3TVC7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccndbp1Q3TVC7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ccndbp1Q3TVC7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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