Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms