Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms