Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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