Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pate4Q09098 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms