Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MestQ07646 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms