Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms