Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms