Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GscQ02591 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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GscQ02591 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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GscQ02591 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GscQ02591 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GscQ02591 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GscQ02591 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
GscQ02591 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GscQ02591 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GscQ02591 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
GscQ02591 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GscQ02591 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
GscQ02591 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GscQ02591 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GscQ02591 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GscQ02591 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms