Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms