Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Npas1P97459 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Npas1P97459 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Npas1P97459 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Npas1P97459 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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