Protein–RNA interactions for Protein: P86792

Ccl21b, C-C motif chemokine 21b, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21bP86792 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21bP86792 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms