Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx1P80205 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms