Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tp53bp1P70399 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Tp53bp1P70399 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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