Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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