Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms