Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcmtd1P59913 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms