Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CgnP59242 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CgnP59242 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CgnP59242 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CgnP59242 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CgnP59242 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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