Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms