Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtswP56203 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtswP56203 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtswP56203 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtswP56203 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtswP56203 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtswP56203 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtswP56203 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtswP56203 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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