Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcd3P55096 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms