Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms