Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TspoP50637 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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