Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc3P49135 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc3P49135 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc3P49135 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc3P49135 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc3P49135 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc3P49135 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc3P49135 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc3P49135 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc3P49135 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc3P49135 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc3P49135 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc3P49135 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc3P49135 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc3P49135 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc3P49135 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms