Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LmnaP48678 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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