Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LifrP42703 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LifrP42703 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LifrP42703 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms