Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-2P42580 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms