Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtbP41155 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtbP41155 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms