Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa2P28309 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa2P28309 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms