Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18532 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18532 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18532 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18532 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18532 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18532 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18532 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18532 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18532 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18532 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18532 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18532 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms