Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Spi1P17433 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Spi1P17433 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Spi1P17433 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Spi1P17433 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms