Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01853 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01853 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01853 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01853 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01853 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01853 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01853 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01853 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01853 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01853 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P01853 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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