Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms