Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f6O54917 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms