Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clk2O35491 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clk2O35491 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clk2O35491 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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