Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MttpO08601 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MttpO08601 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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