Protein–RNA interactions for Protein: L7N280

Gm21962, Predicted gene, 21962, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21962L7N280 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21962L7N280 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms