Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Top6blJ3QMY9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top6blJ3QMY9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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