Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm3336J3QMQ6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm3336J3QMQ6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm3336J3QMQ6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm3336J3QMQ6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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