Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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