Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms