Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp72F8VQC1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms