Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8247F6VRJ8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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