Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4E9QAP7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms