Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms